Родиной фландрского бувье (Bouvier des Flandres) являются земли средневекового графства Фландрии, принадлежавшего частично Бельгии, Франции и Нидерландам. Предками фландрского бувье были крупные и выносливые пастушьи собаки - грубошерстные овчарки Европы, среди которых можно назвать прежде всего бельгийскую овчарку лакенау, французских овчарок - бриара и пикардийскую, а также голландскую грубошерстную овчарку. Эти собаки, известные с 17 века, славились превосходными рабочими качествами.

С давних времён для фермы универсальный Бувье был идеальной породой. Бувье выполняли самую разнообразную работу, в том числе с помощью их перевозили грузы, например, бидоны с молоком, для чего собак запрягали в специальные тележки. Лохматые помощники крутили также жернова на мельнице и колесо маслобойки. Бувье принимали участие практически во всем, что происходило в хозяйстве, но основное его назначение - загон крупного рогатого скота и охрана.
Отсюда произошло и название Bouvier - «погонщик быков», хотя у фландрского бувье было много названий, среди которых - "грязная борода", "коровья собака", "коровий пастух", и лишь много позже появилось современное название.

Впервые фландрский бувье был продемонстрирован на выставке в Брюсселе в 1910 году.

В 1912 году был разработан стандарт породы, и тогда же во Фландрии было организовано общество заводчиков этой породы. Заслуга бельгийских собаководов в том, что, получив бувье превосходного типа, они сумели сохранить ценные качества породы.

Порода Bouvier des Flandres становилась все более и более популярной и к началу первой мировой войны приобрела множество почитателей. Бувье добился широкого признания в годы первой мировой войны, когда проявили недюжинную силу и храбрость, разнося армейские донесения и разыскивая раненых и вытаскивая их из-под огня. Из-за нехватки лошадей фландрских бувье использовали в упряжках для вывоза раненых и для доставки различных грузов.
Но, к сожалению, Первая мировая война нанесла породе Bouvier des Flandres значительный ущерб. В районах Бельгии, где было сосредоточено основное поголовье, авиацией противников велись наиболее сильные бомбардировки. В результате большая часть бувье в Бельгии погибла или была вывезена в Германию (где в 1914-1918 годах они послужили основой для выведения породы ризеншнауцер, хотя немцы стараются об этом не говорить).

На родине породы благодаря усилиям энтузиастов нескольких фландрских бувье удалось сохранить. Эти единичные экземпляры были использованы после войны для восстановления породы. Собаки военного ветеринара капитана Бабри, особенно Чемпион Ник де Соттегем, идеальный по типу, сыграли в возрождении породы большую роль. Ник, выставленный в Антверпене в 1920 г., был признан эталоном породы Bouvier des Flandres: он обладал коротким туловищем с хорошо развитыми конечностями, головой прекрасной формы, глубокими серьезными глазами с отважным взглядом, сухой и темной шерстью. Потомки Ника составляют лучшую часть поголовья современных бувье де фландрс.

Внешне бувье того времени сильно отличались от современных собак. Обновленный стандарт был принят в Бельгии в 1923 году.

Несколько позже он был признан и американским клубом "Кеннел". В США фландрские бувье стали популярными после 1940-х годов. Известности этой породы очень способствовала Жаклин Кеннеди, жена американского президента, которая по происхождению была француженкой.

Собак породы Bouvier des Flandres стали и в Америке применять в качестве полицейских и спортивных.